Черные трюфели (Клубень melanosporum), также известный как трюфели Perigord, имеют густой сладкий аромат и высоко оценены в изысканной кухне. Они – грибы, которые растут на корнях дубов и лесных орехов, и являются вторыми самыми дорогими разновидностями трюфеля. Больше чем 58% 125 Mbp, черный геном трюфеля составлен из повторения и ‘подскакивающих генов’ – разделы ДНК, которая может переместиться в геноме.ДНК methylation является наследственной эпигенетической модификацией генов, где группа метила добавлена к цитозиновым нуклеотидам ДНК.
Это вовлечено в регулирование многих генетических процессов, и ученые анализируют methylomes, чтобы получить картину всего генома его.Ученые из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе и Университета Пармы измерили пропорцию цитозинов, которые были methylated в черном геноме трюфеля в различных стадиях развития: fruitbody – сексуальная стадия и фактический трюфель, свободный живущий мицелий – гриб самостоятельно, и ectomycorrhiza – гриб, сосуществующий с корнями дерева.
Они нашли высокий показатель methylation – 44%. Места элемента транспозона, намного более вероятно, будут methylated, чем гены, которые имели тенденцию быть demethylated. Они нашли, что methylation мог быть частично полностью изменен лечением с 5-azacytidine, аналогом цитидина, приводящего к оживлению определенных транспозонов.
Доктор Симоне Оттонелло, из Университета Пармы, Италия заявляет: «Если расширено на черные трюфели из различных географических областей, epigenomic исследования, такие как то, описанное в этой работе, может пролить свет на отношения между ДНК methylation и установленным транспозоном формированием генома, внутривидовой изменчивостью и коммерчески соответствующими органолептическими чертами, такими как аромат и цвет»Доктор Маттео Пеллегрини, из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе говорит: «Этот обратимый methylation может увеличить пластичность генома трюфеля, позволив ему приспособиться к его среде. Поскольку трюфель живет метрополитен и не имеет активной системы рассеивания споры, этому, возможно, понадобилась бы эта пластичность, чтобы приспособиться к внезапным изменениям окружающей среды».Доктор Пэо-Янг Чен, из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе говорит: «Вместо methylated генного тела или покровителей, которых мы обычно видим в растениях и животных, у черного трюфеля есть очень мало генного тела methylation, и кажется, что methylation происходит в транспозоне.
Все это означает, что у трюфеля есть очень уникальный образец ДНК methylation, который может играть роль в регуляции генов».