В защиту моделей мыши для изучения человеческих беспорядков

Профессор Тсуиоши Миякоа из медицинского Университета Фудзиты и Адъюнкт-профессор Кейзо Тэкэо, от Национального Института Физиологических Наук в Японии, применили более соответствующие и более чувствительные методы для обнаружения общих черт образцов экспрессии гена, чем примененный в оригинальной газете PNAS, чтобы повторно проанализировать те же самые наборы данных, используемые в Seok и др., профессор Миякоа сказал, «Заявил один из авторов Seok и др. в интервью New York Times, что, когда статья была отклонена по своей природе и Наука, они получили комментарии, такие как, ‘Это должно быть неправильно’. У меня было то же самое впечатление как рецензенты». Доктор Миякоа и доктор Тэкэо тогда повторно проанализировали данные, используемые в Seok и др. бумага, и нашли несоответствующие методы в оригинальных исследованиях, приведя их к заключению полностью напротив того из Seok и др.

Seok и др. сравнил уровни экспрессии генов, которые были изменены в конкретном человеческом условии болезни между людьми и мышами, независимо от того, были ли гены изменены у мышей. Сравнение геномного ответа между людьми и мышами, включая те гены, измененные в одной разновидности, но не в другом, затеняет корреляцию между соответственными генами людей и мышей к почти нолю, как продемонстрировано Seok и др.

В Seok и др., сравнение образцов экспрессии гена между человеческим ожогом и моделями мыши ожогов, травмы, сепсиса и инфекции показало коэффициент Пирсона корреляции (R), это колебалось от 0,14 до 0,28, и процент генов, выражение которых изменилось в том же самом направлении, составлял 55% к 61%, не указывая ни на какую корреляцию вообще. В настоящем отчете, на основе тех же самых наборов данных, используемых в Seok и др., ценности R колебались от 0,36 до 0,59, и 77% к 93% генов изменились в тех же самых направлениях между человеческой болезнью и моделью мыши. Кроме того, в данной работе, авторы провели более сложные непредубежденные статистические исследования подобия между генными компаниями людей и мышей, использующих инструмент биоинформатики NextBio.

Непараметрический аналитический NextBio использования рейтинга продемонстрировал, что образец изменений экспрессии гена в моделях мыши был очень подобен этому в человеческих условиях ожога с чрезвычайно высокой уверенностью (p-стоимость наложения = 1.2 x 10-35 – 6.5 x 10-11).Много молекулярных путей обычно dysregulated при человеческих болезнях и моделях мыши.

Многочисленные пути, однако, обычно не затрагиваются при человеческих болезнях и моделях мыши. Сосредоточение на общностях между человеческими болезнями и моделями мыши позволит нам получать полезную информацию для изучения патофизиологии и патогенеза человеческих болезней, и для развития лечения.