Результаты изданы онлайн в выпуске 15 мая Коммуникаций Природы.Исследовательская группа, во главе с ведущим автором Гэри С. Фирештайном, Мэриленд, декан и объединенный вице-канцлер переводной медицины в Медицинской школе Сан-Диего UC, заявил, что неожиданная связь между РА и болезнью Хантингтона открывает возможность новых терапевтических целей и наркотиков для обоих условий.«Мы не ожидали находить наложение между ревматоидным артритом и болезнью Хантингтона, но обнаружением, что неожиданной была причина, что мы разработали эту технологию. Теперь, когда мы раскрыли эту связь, мы надеемся, что она открывает дверь для вариантов лечения для людей, живущих с любой болезнью», сказал Фирештайн.
РА – хроническое воспалительное заболевание, которое причиняет боль и раздувающийся в суставах. Как аутоиммунная болезнь, это может также затронуть другие органы, включая сердце и кровеносные сосуды. Лечение РА улучшилось, но 10 – 20 процентов пациентов не отвечают ни на какие доступные лекарства.Следственный подход, используемый исследовательской группой, включил развитие нового алгоритма или набора вычислительных правил, названных EpiSig, который объединил и сократил количество эпигенетических комбинаций в генах пациентов с РА.
Команда могла тогда определить новую клетку сигнальные пути.«Сравнение различных типов epigenomic данных трудное, потому что это включает множество различных подмножеств данных, которые не могут обычно анализироваться вместе, включая различные методы, в которых изменена DNA», сказал Вэй Ван, доктор философии, преподаватель химии, биохимии и клеточной и молекулярной медицины в Медицинской школе Сан-Диего UC.«Эта методология может также использоваться, чтобы найти связи между другими болезнями, не только ревматоидным артритом», добавил Фирештайн. «Поскольку включенные гены обнаружены, исследователи могут потенциально определить новые варианты лечения и даже перецель существующие наркотики».Фирештайн и команда изучили эпигеном в клетках от суставов пациентов с РА.
Пациенты с остеоартритом, который является болезнью вырождения хряща, служили контрольной группой. Оба набора данных были проанализированы посредством экспансивного процесса, который исследует хроматин, ДНК и модификации гистона. Результаты произвели 12 терабайт данных (12 триллионов байтов), которые были тогда проанализированы, используя EpiSig.Эпигенетика, или «выше генома», является исследованием процессов, которые изменяют генную структуру, не изменяя саму последовательность ДНК.
Эти модификации ДНК важны для человеческого роста и развития и изменения в течение жизней людей. Эпигенетические изменения под влиянием множества факторов окружающей среды, включая напряжение, деятельность и выбор образа жизни.
«Показывая всестороннюю эпигенетику позади ревматоидного артрита, у нас теперь есть лучшее понимание этой болезни. Что еще более важно, наш новый подход, мог не только помочь пациентам с ревматоидным артритом, но также и людям с другими свободно установленными болезнями», сказал Фирештайн.