Недостаточность витамина D есть причиной риска для многих заболеваний и так, есть возрастающим тревогой во всем мире, потому, что примерно один миллиард человек возможно недостаточным витамином D. Но биологическое основание для предрасположения недостатка витамина D к заболеванию не хорошо осознано. В отчете, опубликованном онлайн в Изучении Генома, ученые картировали молекулярные сотрудничества рецептора витамина D находящие новые связи всего генома витамина D с генами, которые связаны с раком и аутоиммунной болезнью.Недостаток витамина D, следуя либо из отсутствия инсоляции либо из бедного диетического потребления, все более и более признан как фактор риска для многих серьёзных заболеваний и был связан с аутоиммунными условиями, такими как рассеянный склероз, ревматоидный 1 артрит и диабет типа.
Все же совершенно верно то, как витамин D вовлечен в заболевание, по большей части неизвестно. Исследователи подозревают, что генетика имела возможность содействовать связи.Витамин D проявляет собственные эффекты на гены через рецептор витамина D (VDR), связывающий с определенными расположениями генома, дабы оказывать влияние на экспрессию гена. Интернациональная команда исследователей из Соединенного Канады и Королевства сейчас картировала места связывания VDR, информация, которую они смогут тогда применять, дабы идентифицировать связанные с заболеванием гены, на каковые имел возможность бы воздействовать витамин D.
Применяя способ называющиеся ЧИП-seq, врач Срирэм Рамагопалан, Центра Wellcome Trust Людской Генетики в Оксфордском университете и сотрудников выделил фрагменты геномной ДНК, которая связана с VDR прежде и по окончании лечения клеток с кальцитриолом, активной формой витамина D, и после этого упорядочил фрагменты ДНК. Методом картографии последовательностей назад к геному, они идентифицировали больше чем 2 700 мест связывания VDR, число, которое отметил Рамагопалан, «показывает, как ответственный витамин D большому разнообразию и людям биологических проводящих дорог, в которых витамин D играет роль».Сейчас, изучения ассоциации всего генома (GWAS) раскрыли бессчётные геномные области, питающие генетические варианты, присуждающие повышенный риск для заболевания. Дабы идентифицировать потенциальные генетические связи между витамином D и заболеванием, несколько проанализировала узнаваемые связанные с заболеванием области генома, ища обогащение VDR, связывающего в этих промежутках.
Они нашли, что связывание VDR существенно обогащено в геномных областях, которые связаны с несколькими неспециализированными аутоиммунными заболеваниями, такими как рассеянный склероз, болезнь 1 Крона и диабет типа. Существенно, анализ продемонстрировал новую роль для витамина D в нескольких генах заболевания, информация, которая будет критической для будущих расследований. Связывание VDR было кроме этого обогащено в регионах, которые связаны с раковыми образованиями, такими как рак и лейкоз ободочной и прямой кишки а также неспециализированные черты, такие как дубление, цвет и высота волос.
Рамагопалан растолковал, что их результаты изучения оказывают большую помощь догадке, что витамин D взаимодействует с генами в патогенезе этих заболеваний и подчеркивает важные риски недостатка витамина D, специально для людей, каковые смогут быть генетически склонны, дабы быть чувствительными к недостаточности. «Рассмотрение дополнения витамина D как профилактическая мера для этих заболеваний очень сильно гарантировано», добавил Рамагопалан.Ученые из Оксфордского университета (Оксфорд, Англия), Barts и английская Стоматология и Медицинская школа (Лондон, Англия), и Университет Саймона Фрейзера (Бернаби, Канада) содействовали этому изучению.
Эта работа была поддержана Обществом Рассеянного склероза Канадского Фонда Научного изучения, Обществом Рассеянного Северной Ирландии и склероза Великобритании, Совета по медицинским изучениям (Англия) и Wellcome семь дней (Англия).О статьеРукопись будет издана онлайн перед печатью 24 августа 2010. Его полная цитата следующие:
Ramagopalan SV, Heger A, Berlanga AJ, Мауджери НЙ, Линкольн МР, Баррел А, Handunnetthi L, Гендель Э, Disanto G, Ортон С, КТ Уотсона, Morahan JM, Giovannoni G, Понтинг КП, Эберс ГК, Найт ДЖК. Карта всего генома ChIP-seq-defined связывания рецептора витамина D: Связи с развитием и болезнью.
Геном Res doi:10.1101/gr.107920.110.Источник: Cold Spring Harbor Laboratory Press