Почти каждый биологический процесс зависит от взаимодействия белков и сборки в комплексы в особенном методе, и много болезней связаны с проблемами на сложном собрании. Принципы, подкрепляющие эту организацию, полностью еще не поняты, но определив фундаментальные шаги в эволюции комплексов белка, новая ‘периодическая таблица’ представляет систематическое, заказанное представление о собрании белка, обеспечивая визуальный инструмент для понимания биологической функции.«Эволюция дала начало огромному множеству комплексов белка, и это может казаться немного хаотичным», объясняет Джо Марш, раньше Кампуса Генома Wellcome и теперь Человеческой Единицы Генетики MRC в Эдинбургском университете. «Но если Вы ломаетесь, белки шагов берут, чтобы стать комплексами, есть некоторые основные правила, которые могут объяснить, что почти все люди собраний наблюдали до сих пор».Различные бальные танцы могут быть рассмотрены как бесконечная комбинация небольшого количества основных шагов.
Точно так же ‘танец’ собрания комплекса белка может быть рассмотрен как бесконечные изменения на димеризации (каждый удваивается и становится два), циклизация (каждый формирует кольцо три или больше), и дополнение подъединицы (два различных белка связывают друг с другом). Поскольку они происходят довольно предсказуемым способом, это не настолько твердо, как Вы могли бы думать, чтобы предсказать, как новый белок сформируется.«Мы приносим большой заказ в грязный мир комплексов белка», объясняет Себастьян Анерт из Кавендишской лаборатории в Кембриджском университете, физик, который регулярно ругается с биологическими проблемами. «Белки могут держать, проходят несколько повторений этих простых шагов, добавляя все больше уровней сложности и приводя к огромному множеству структур.
То, что мы сделали, является классификацией на основе этих основных принципов, которая помогает людям получить ручку на сложности».Исключения из правила интересны самостоятельно, добавляет Себастьян, как предмет продолжающихся исследований.
«Анализируя десятки тысяч комплексов белка, для которых были уже экспериментально определены трехмерные структуры, мы видели повторяющиеся образцы в переходах собрания, которые происходят – и с новыми данными из масс-спектрометрии мы могли начать видеть большую картину», говорит Джо.«Основная работа для этого исследования находится в теоретической физике и вычислительной биологии, но это, возможно, не было сделано без работы масс-спектрометрии наших коллег в Оксфордском университете», добавляет Сара Тейчман, Лидер исследовательской группы в европейском Институте Биоинформатики (EMBL-EBI) и Институте Wellcome Trust Sanger. «Это – еще один превосходный пример того, как чрезвычайно ценное междисциплинарное исследование может быть».