Крошечная DNA Reader Heralds быстрое, дешевое упорядочивание

Возможность дешёвой персонализированной медицины посредством «упорядочивание генома, тогда как Вы ожидаете», была принесена ход ближе этосемь дней, в то время, когда изучение во главе с университетом Вашингтонского учителя физики продемонстрировало, как маленький наноразмерный датчик может просматриватьпоследовательность единственной Молекулы ДНК в пути, дающем слово быть недорогим и стремительным.Таковой способ имел возможность сделать ДНК, упорядочивающую более обширно дешёвую, разрешающую персонализированную медицину, дабы оказать помощь людямопределите, чувствительны ли они к раку, диабету, склонности и вторым заболеваниям с генетическими факторами риска.Йенс Гундлах, обрисовывающий себя как экспериментального физика с заинтересованностями к фундаментальной физике и биофизике, иколлеги, напишите об их работе в сетевой проблеме 26 марта Биотехнологии Природы.Они обрисовывают, как методом приложения молекулярного двигателя к протеиновой апертуре нанопоры они умели заставлять нить ДНК двигатьсячерез пору один нуклеотид за один раз, разрешая им прочесть маленький характерный ионный ток каждого нуклеотида, в aобраз, напоминающий о ветхих автомобилях ленты тикера, применяемых для чтения информации, передал вниз телеграфные линии.

Гандлак сообщил СМИ, что их работа показывает «ясный путь к осуществимой, легко произведенной платформе упорядочивания».В их статье команды обрисовывают применение нового способа нанопоры, дабы верно идентифицировать шесть уже известных последовательностей ДНКв пределах от 42 – 53 нуклеотидов в длине.Они уже генетически спроектировали протеиновую нанопору от бактерии называющиеся Микобактерия smegmatis размышление(MspA), имеющий апертуру примерно 1 миллиардная часть метра в размере, легко большом, дабы разрешить единственному берегу ДНК проходитьчерез.

Они приложили пору MspA в двухслойной мембране липида и купали целое в хлориде калия. Использование напряжения кмембрана формирует ток иона, текущий через протеиновую пору так, дабы, в то время, когда молекулы проходят через апертуру, ихгенерируйте мелкое, но поддающееся обнаружению, изменение в токе.

Мысль разработки нанопоры ввести более стремительное, более недорогое упорядочивание ДНК (это уменьшает число нужных шагов, дляпример при чтении генома человека), не есть новым. Существует большое количество работающих научного исследования и центров частногоэто.Но то, что делает эту совокупность отличающейся, есть ею, разрешает нити ДНК быть вылеченной один nucloetide за один раз, в медленном темпедостаточно идентифицировать любой из четырех нуклеотидов ДНК, цитозина, гуанина, аденина либо тимина, от его характерного тока ионаподпись.Прошлые совокупности не были в состоянии различать четыре разных нуклеотида.

Гандлак сообщил:«Двигатель тянет берег через пору на управляемой скорости десятков миллисекунд за нуклеотид, что есть достаточно медленнымбыть в состоянии прочесть текущий сигнал."Команда сделала двигатель из фермента вирусного повторного изучения названным полимеразой ДНК бактериофага (DNAP) phi29.

Исследователи в Калифорнийском университете, Санта-Круз попытался двигатель посредством этого фермента, но они применяли разную пору этоне имел возможности отличить нуклеотиды.Команды предполагают, что способ имел возможность употребляться, дабы выяснить эпигенетические трансформации в ДНК. Эпигенетические трансформации ответственны для вещейкак рак: они показывают, как инструкции, проводимые в ДНК, смогут быть выражены по-второму в клетках.Свойство выяснить эпигенетические трансформации «есть одним из очарования способа упорядочивания нанопоры», сообщил Гандлак.

Программа, которой руководит Национальный НИИ генома человека (NHGRI), помогла финансировать изучение. Программа пытается обнаружитьметод упорядочить отдельную ДНК меньше чем за 1 000$.

Грандлак заявил, что область «двигалась скоро». В то время, когда программа NHGRI началась, цена отдельной последовательности ДНК будетбыли в шести числах.

Сейчас, «с способами как это это имело возможность бы перейти к 10 долларам либо 15-минутный проект генома», онсообщённый.


Блог Парамона