Чтобы обратиться к этой проблеме, в 2010, американскому Национальному Сердцу, Легкому и Следующему поколению Института Крови (NHLBI), Генетический Консорциум Исследований Ассоциации спонсировал ряд исследований, которые начали тяжелую работу анализа клеток вызванной плюрипотентной основы (iPS), собранных от многочисленных групп пациентов, чтобы узнать больше, как отдельные мутации способствуют полигенетическим заболеваниям. Теперь, группа из 11 отчетов, следующих из совместного усилия, появляется в Стволовой клетке Клетки, Отчетах о Стволовой клетке и EBioMedicine. Доклады сделаны на интерактивном веб-портале, http://www.cell.com/consortium/NextGen.«Когда это началось, область стволовой клетки начала переходить к сути дела, где Вы могли собраться делать клетки IPS в масштабе для, возможно, сотен или тысяч людей», говорит Чед Коуон из Института Стволовой клетки Гарварда, Центральной больницы Массачусетса и Широкого Института. «Время было правильным, и у NHLBI было видение, чтобы знать, что следующий шаг в исследованиях ассоциации всего генома должен систематически опрашивать молекулярные механизмы определенных генов с в клетках IPS».
Проблема, которую консорциум стремился преодолевать, была: если у условия – такого как сердечно-сосудистое заболевание – есть более чем 100 мутаций, которые могли бы способствовать его причине, как Вы измеряете роль каждого гена? Модели животных вряд ли помогут, потому что изменения могут быть слишком тонкими, и учащимися линиями стволовой клетки от одного человека, не рассказал бы целую историю, поскольку люди несут различные генетические факторы риска. Так, исследовательские группы произвели клеточные линии IPS – каждого требующего приблизительно 4-6 месяцев труда и стоящий до $20 000 – от сотен людей оценить физиологическое изменение.Этот ресурс уже приводит к нескольким урокам: один, количество линий стволовой клетки должно было проанализировать полигенетическое заболевание, может не потребовать сотен образцов.
Кауэн, кто посмотрел на отклонения метаболизма печени, нашел, что его группа могла получить результаты с меньшей коллекцией клеток. Два, очень небольшие изменения в экспрессии гена могли привести к удивительно разительным переменам в клетке, и исследователям любопытно узнать как. Три, некоторые мутации эффектов имеют на клетках, может проявить, прежде чем стволовые клетки дифференцированы.
«В то время как iPSCs показывают значительное обещание как дополнение к исследованиям ассоциации всего генома в понимании функционального основания изменения, есть все еще довольно большая работа, чтобы сделать с точки зрения стандартизации протоколов и понимания методов наиболее успешной практики, чтобы сделать этот тип из подхода надежным инструментом открытия», пишет редактор Стволовой клетки Клетки Дебора Свит в передовой статье о консорциуме (DOI: 10.1016/j.stem.2017.03.020). «Потенциал там, тем не менее, и это – захватывающая перспектива, чтобы рассмотреть».Работа также будет полезна, чтобы установить фундаментальные стандартные блоки для изучения полигенетических заболеваний. Например, эти клеточные линии – что-то, что исследователи могут заказать от дистрибьютора (WiCell) в ближайшем будущем. Усилия могут также привести к более целенаправленной терапии.
Другие крупномасштабные научно-исследовательские работы с целями, подобными тем из Консорциума NextGen, также происходят. В Европе есть Инициатива HipSci в Великобритании и проект ЕС StemBANCC.