Атлас Генома Рака – сотрудничество между National Cancer Institute (NCI) и Институтом National Human Genome Research (NHGR), который делает общедоступную геномную информацию об образцах опухоли от 33 различных типов раковых образований. Его цель состоит в том, чтобы помочь сообществу исследований рака улучшить предотвращение, диагноз и лечение рака.
Считается, что есть две главных формы СВЯЗАННЫХ С HPV раковых образований, episomal и интегрированы. В episomal вариантах геном HPV копирует независимо. Интегрированный HPV стал частью ДНК клетки – хозяина и полагается на него для повторения.
Ранее, считалось, что большинство СВЯЗАННЫХ С HPV случаев рака головы и шеи объединило HPV, как то, чему верят со СВЯЗАННЫМ С HPV раком шейки матки. Однако исследование Виндла, недавно опубликованное в журнале Oncotarget, нашло, что ДНК HPV сохраняется отдельная от генома человека в большинстве СВЯЗАННЫХ С HPV раковых образований в голове и шее, тем не менее, во многих случаях, геном HPV может приобрести маленькую часть ДНК человека, заставляющей его быть похожим на интегрированный HPV. Этот вирусно-человеческий гибрид представляет новую категорию episomal HPV при СВЯЗАННЫХ С HPV раковых образованиях.«Наша работа бросает вызов идее, что нахождение ДНК HPV, соединенной с ДНК человека, означает, что HPV объединен.
С этим новым видом на государство HPV мы приходим к заключению, что episomal HPV – преобладающее государство при СВЯЗАННЫХ С HPV раковых образованиях в голове и шее», говорит Брэд Виндл, член Рака Молекулярная программа исследований Генетики в Онкологическом центре VCU Massey, преподаватель в Philips Institute для Исследования Здоровья полости рта в Школе VCU Стоматологии и co-принципиального следователя на исследовании. «Это – важное различие, потому что пациенты с episomal раком HPV лучше отвечают на терапию, чем пациенты с интегрированным раком HPV».Команда Виндла проанализировала геномы всех 520 образцов HNC в Атласе Генома Рака и нашла, что 72 был уверенный HPV. У значительного большинства этих раковых образований был общий тип вируса, известного как подарок HPV16, таким образом, они сосредоточились на том вирусном типе. Данные показали, что у 75 процентов образцов HPV16 был геном HPV в государстве episomal, и приблизительно половина геномов содержала часть ДНК человека в их круглой структуре.
Исследователи также нашли, что 73 процента образцов опухоли все еще зависели от белков, известных как E1 и E2 для повторения. Это важно, потому что, когда геном HPV объединяется с ДНК человека, выражение белка HPV E2 – важный для независимого повторения – потеряно. Присутствие E2 или отсутствие этого, в биопсиях опухоли могло быть надежным способом для врачей решить, что рак печатает и обеспечивает более точный прогноз.
«Возможно, наш самый поразительный результат – потенциал, чтобы предназначаться для E1 и белков E2 для диагноза и лечения», говорит Виндл. Почти с тремя четвертями этих раковых образований, зависящих от E1 и E2 для повторения, мы могли разработать лекарства, которые предназначаются для этих белков и способствуют некрозу клеток."Команда Виндла планирует продолжить изучать интеграцию HPV при СВЯЗАННЫХ С HPV раковых образованиях в голове и шее и предлагает, чтобы гибридный HPV вирусной ДНК человека был далее исследован при СВЯЗАННОМ С HPV раке шейки матки.
Его команда в настоящее время работает с клиницистами Massey, чтобы использовать эту информацию, чтобы оценить прогноз пациентов в клинике.